S2000のトラブル・ECU書き換え・原因不明・教えてください・助けてくださいに関するカスタム事例

皆さんに質問です。

先週バッテリーを交換して本日走行した所レブが8600から純正の8000に戻ってしまっている事にきづきました。

空ぶかしと加速時も調べましたが8000でレブに当たっているようです。

正確な回転数がわかる物はついていませんが明らかに8600以下でレブに当たっている事は確認しました。

この件を販売店に問い合わせた所、そんな事はありえないし、考えられるとするとコンピュータの信号にかませるスピードリミッターカットやレブカウンターなどが悪さをしていて、コンピュータの変更内容がバッテリーの交換でデータが変わる構造ではないのでコンピュータではなく車両側の問題の可能性が高いとの返答でした。
これは全て理解できるし私も同じ意見なのですが、私は計器類は一切つけておりませんし、コンピュータを書き換えてから電装系はイグニッションコイルを変更した程度（コイル交換後は8600回るの確認済み）で原因が全くの不明なのです。

一応確認で学習プログラムによって最初はレブを下げているのか？との確認をしましたが否。

もしくはカムチェーンテンショナー？（これも交換後確認済み）

どの道販売店のほうに一度書き換えで持って行く事になりそうなのでしばらく時間が取れず、それまでに原因追究をできるならしておきたいので何が考えられるのか、どんな些細な情報でも良いのでコメント等もらえると嬉しいです。